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N-Fmoc-S-三苯甲基-L-高半胱氨酸
[CAS 167015-23-8]

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基本信息
产品分类生物化工 >> 氨基酸及其衍生物 >> 半胱氨酸类衍生物
产品名称N-Fmoc-S-三苯甲基-L-高半胱氨酸
英文名N-Fmoc-S-trityl-L-homocysteine
别名Fmoc-Hcys(Trt)-OH; (S)-2-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonylamino)-4-(tritylthio)butanoic acid
分子结构N-Fmoc-S-三苯甲基-L-高半胱氨酸分子结构 (CAS 167015-23-8)
分子式C38H33NO4S
分子量599.74
CAS 登录号167015-23-8
分子行输入简码
SMILES
C1=CC=C(C=C1)C(C2=CC=CC=C2)(C3=CC=CC=C3)SCC[C@@H](C(=O)O)NC(=O)OCC4C5=CC=CC=C5C6=CC=CC=C46
物理化学性质
密度1.3±0.1 g/cm3 计算值*
沸点780.1±60.0 °C 760 mmHg (计算值)*
闪点425.6±32.9 °C (计算值)*
溶解度1 mM in 2 mL DMF (实验值)
折射率1.649 (计算值)*
*使用计算机软件 Advanced Chemistry Development (ACD/Labs) Software.
安全数据
危险品标志symbol   GHS07 警告  说明
危害标签H302-H315-H319-H335  说明
防护标签P261-P305+P351+P338  说明
SDS化学品安全技术说明书参考文本
up chemBlink 化学品故事
合成中最有用的原子,有时会先帮助成键,再通过化学编辑承担最终角色。N-Fmoc-S-三苯甲基-L-高半胱氨酸(CAS 167015-23-8)在肽化学中支持这一思路:高半胱氨酸核心可提供含硫的化学连接位点,随后硫甲基化可形成蛋氨酸侧链。

高半胱氨酸比半胱氨酸在 α-碳与硫之间多一个亚甲基,侧链为 CH2CH2SH,而不是 CH2SH。蛋氨酸则是相应的甲基硫醚 CH2CH2SCH3。因此,对硫进行修饰,可将高半胱氨酸残基转为蛋氨酸残基,不必向肽主链再插入一个碳。

本 CAS 对应的不是游离高半胱氨酸。Fmoc 保护氨基,三苯甲基保护巯基。这些临时基团帮助氨基酸单元经历适当组装过程。相关后续阶段必须使硫开放;保护仍在时,S-三苯甲基衍生物并不具备同样的游离巯基反应性。

天然化学连接通过适当的硫酯与氨基端含巯基残基反应,再重排为酰胺键,将肽片段连接起来。高半胱氨酸可用于这一化学的变式,硫不是旁观取代基,而是暂时参与并帮助形成连接途径。最终肽键与最初的硫连接中间体属于不同化学状态。

2006 年,Saporito 等人报道了在 X-Met 位点连接、化学合成含 63 个残基的细菌 GstI 蛋白。这提供了利用高半胱氨酸、再转向含蛋氨酸产物的策略实例。其意义在于通过化学合成获得确定蛋白,并非声称受保护氨基酸原料本身具有该蛋白的功能。

X-Met 表示最终肽键相对于蛋氨酸的位置,X 是前一个残基的占位符,而非某一元素。蛋白序列中的蛋氨酸位置,有时适合作为片段连接处。暂时的含硫反应位点,因此可能扩展将较大目标拆分为合成片段的选择。

这种扩展也带来选择性问题。较大肽中可能还有其他亲核基团、硫原子或易氧化位置。完成一个残基转化,并不能保证其余官能团均保持不变。表征需同时证明片段连接成功及最终侧链身份正确。预期质量有参考价值,但位置归属与纯度可能还需其他分析证据。

追踪侧链碳原子,可以避免误解这一编辑步骤。高半胱氨酸原有的两个亚甲基仍位于主链与硫之间,新加甲基则位于硫的另一侧;不是给氮增加甲基,也不是延长主链。这种逐原子关系解释了为什么可生成蛋氨酸,而不是某种取代方式不明的“甲基化氨基酸”。

因此,这个故事是临时反应性与永久编辑的结合:Fmoc 与三苯甲基帮助管理砌块,高半胱氨酸提供有用的中间侧链,最终分子却可含蛋氨酸。这说明化学蛋白合成可以利用一种在构建时有用、而最终结构需要换为另一身份的残基。

参考文献:
1. Bachem. Fmoc-Homocys(Trt)-OH, product 4025118; CAS 167015-23-8 and ligation application. https://shop.bachem.com/product/4025118/
2. Saporito A et al. The chemical synthesis of the GstI protein by NCL on a X-Met site. Biopolymers (2006). https://doi.org/10.1002/bip.20582

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